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xan

项目核心内容总结:

xan 是一个功能强大的命令行工具,主要用于处理和分析结构化数据(如CSV、TSV等)。其核心功能包括数据转换、合并、可视化、网络分析等,支持多种文件格式(如JSON、VCF、GFF等)和压缩文件(如gz、zst)。主要特性包括:

  1. 功能

    • 支持数据清洗、聚合、转换、网络构建、矩阵生成等操作。
    • 提供丰富的命令(如joinnetworkmatrixcluster等)和表达式语言(支持复杂计算和文本处理)。
    • 支持并行计算(通过parallel命令)和生物信息学格式(如SAM、BED)的解析。
  2. 使用方法

    • 通过命令行操作,输入输出支持标准CSV及多种格式,可结合管道符进行多步骤处理。
    • 使用-d指定自定义分隔符,-n处理无表头文件,-o指定输出路径。
    • 支持从标准输入(stdin)读取数据,结果输出至标准输出(stdout)或文件。
  3. 主要特性

    • 多格式兼容:自动识别.csv.tsv.jsonl.vcf等格式,支持压缩文件(gz、zst)。
    • 表达式语言:提供类似编程语言的语法,用于数据筛选、计算和文本处理。
    • 高效处理:支持并行计算,适用于大规模数据集。
    • 可视化辅助:部分命令(如view)支持终端内简单可视化(如表格显示)。

适用场景:数据预处理、生物信息学分析、网络数据构建、文本聚类等。